Christine Musselin ist Mitglied des Centre de sociologie des organisations (CSO), einer Forschungseinheit von Sciences Po und CNRS, die sie von 2007 bis 2013 leitete. Anschließend war sie bis 2018 Vizepräsidentin für Forschung von Sciences Po. Sie leitet vergleichende Studien zu den Themen Universitätsmanagement, Hochschulpolitik und akademischen Arbeitsmärkten. Im Laufe ihrer akademischen Laufbahn war sie von 1984 bis 1985 Stipendiatin des Deutschen Akademischen Austauschdienstes (DAAD) und von 1998 bis 1999 Fulbright- und Harvard-Stipendiatin.
Von 2011 bis 2014 war Christine Musselin Mitglied des Haut Conseil de l’évaluation de la recherche et de l’enseignement supérieur (Hcéres). Von 2009 bis 2015 war sie außerdem Mitglied der Strategiekommission der deutschen Exzellenzinitiative und von 2014 bis 2021 Mitglied des Verwaltungsrats des CNRS. Sie ist die Autorin von The long March of French Universities, New York, Routledge (2005) und The markets for academics, New York, Routledge (2009). Eines ihrer letzten Bücher, La grande course des universités, wurde 2017 im Verlag Presses de Sciences Po veröffentlicht.